郑勋睿担任漕运总督的时候，大力清理了淮北四府三州的衙役，凡是有劣迹的衙役，一律开革，留下来的衙役，进行严格的考核，年纪大的也要开革，但可以给与一定的补助，同时给府州县规定了衙役的具体数目，不得超过，经过如此的清理之后，衙役的俸禄也纳入到官府的开销之中，也就是让衙役也有了正式的俸禄。
官绅一体纳粮的事宜还在进行的时候，郑勋睿就已经开始考虑增加官吏俸禄的事宜了。
这件事情很快就传出去了，毕竟淮北四府三州的例子摆在那里，应天府、苏州府、松江府等地的官吏，不知道有多羡慕，听到这样的传闻，各级官吏热情高涨，做事情格外的卖力。
郑勋睿也有难题，那就是南京六部的官吏，人数不少，这是一大块的负担。
在淮北的时候，郑勋睿不需要考虑那么多的事情，漕运总督衙门的官吏，同样进行了裁撤，最终保留的只有一百来人，可南京六部、都察院等官府的官吏，总人数达到了四百多人，这是一个沉重的负担。
南京六部、都察院等官府，其最大的特点是官员多，吏员少，南京的各级官府，本来就没有多少的事情，到这里的官员，要么是得罪了朝中的显贵，要么就是遭遇到排挤，没有多大的前途，到南京来养老的，这也让南京的官吏没有多大的斗志，全部都是在混日子。
这是一个烫手的山芋。